目前科学研究表明土壤的肥效在很大程度上取决于土壤中腐植酸的含量。腐植酸的一系列特性像CEC，氧的含量以及保持水分的能力是可以同样解释应用腐植酸增加肥力和增进植物增长的高功效。最重要的是腐植酸可以和金属阳离子、氧气、氢氧化合物结合，从而慢慢积累放他们以供作物便用，由于这些特性腐植酸可有3中效果：物理的、化学的、生态的3种效应。
1、腐植酸的物理特性
腐植酸可以改变土壤的结构
可以在沙地中保持水份及营养物后的散失，同时通过分解使它们形成沃土；针对耕种以及比较硬土地，可以改善土壤的通风透气性，改进耕作条件。
腐植酸可以通过胶合组合使土壤表面涵养水份，防止土壤破裂以及土壤侵蚀。进一步的松软土壤增加土壤的透气性及提高土壤利用率，增加土壤抗旱性，使土壤颜色变黑，更有利于吸收太阳光。
2、化学上的优点
HA可以改变土壤的固定（结合）的特征。
（1）、中和土壤的酸碱性，调节PH值；
（2）、改进和优化作物对营养物质和水份的吸收；
（3）、增加土壤的缓冲性；
（4）、在碱性的环境下，可以螯合金属阳离子增进根部对水份的吸收；
（5）、富含植物增长所需的有机质和矿物质；
（6）、在作物的根部保持水份可溶解无机化肥进而减少他们的渗漏；
（7）、促进（N、P、K）以及微量元素转化成对作物有用的形式；
（8）、增进作物对氮的吸收。
（9）、减少磷与钙、铁、镁、铝的反应，然后将它们转换成可以被植物吸收的形态进而释放出来，同时可以显著提高矿物肥料的利用效率。
（10）、从土壤中的碳酸钙中释放CO2进而促进光合作用的进行。
（11）、可以减少农作物中阳离子的缺失导致的萎黄病。
（12）、可以减少土壤中的有毒物质。